MirGeneDB 3.0

2 Ixodes scapularis microRNA genes with seed GAGAUCA (all species)
Sort by genome coordinates Motifs Tissue expression
- +
MirGeneDB ID MiRBase ID Family Seed 5p accession 3p accession Chromosome Start End Strand Node of origin (locus) Node of origin (family) Iso­miR 3' NTU  UG  UGUG CNNC Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Em Sa Sa To
Isc-Bantam-P9b isc-bantam BANTAM GAGAUCA None MIMAT0012679 NW_024609881.1 54625045 54625105 + I. scapularis Protostomia No
Isc-Bantam-P9a isc-bantam BANTAM GAGAUCA None MIMAT0012679 NW_024609881.1 54625045 54625105 + I. scapularis Protostomia No

(red - mature/co-mature, blue - star)

Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all

Download genome coordinates (GFF format)

Download count matrix