| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Gi | He | In | Li | Sk | Sp | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-10-P1b1 V | gmo-mir-10a-1 | MIR-10 | ACCCUGU | MIMAT0044088 | MIMAT0044089 | GeneScaffold_1009 | 374095 | 374157 | - | Clupeocephala | Eumetazoa | 2 | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-10-P1b2 V | gmo-mir-10b | MIR-10 | ACCCUGU | MIMAT0044188 | None | GeneScaffold_2339 | 30812 | 30870 | + | Clupeocephala | Eumetazoa | 2 | Unknown | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-10-P1c1 V | gmo-mir-10c | MIR-10 | ACCCUGU | MIMAT0044225 | MIMAT0044226 | GeneScaffold_3558 | 107634 | 107699 | + | Clupeocephala | Eumetazoa | 2 | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-10-P1c2 V | gmo-mir-10d | MIR-10 | ACCCUGU | MIMAT0044307 | MIMAT0044308 | GeneScaffold_565 | 163215 | 163274 | - | Clupeocephala | Eumetazoa | 2 | Unknown | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-10-P1d1 V | gmo-mir-10a-2 | MIR-10 | ACCCUGU | MIMAT0044088 | None | GeneScaffold_1797 | 154030 | 154091 | + | Clupeocephala | Eumetazoa | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
