| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Gi | He | In | Li | Sk | Sp | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-17-P2a1 | gmo-mir-18a-2 | MIR-17 | AAGGUGC | MIMAT0046031 | MIMAT0046032 | GeneScaffold_520 | 24343 | 24407 | + | Clupeocephala | Vertebrata | Unknown | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-17-P2a2 | gmo-mir-18a-1 | MIR-17 | AAGGUGC | MIMAT0044321 | None | GeneScaffold_918 | 373010 | 373074 | + | Clupeocephala | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-17-P2c | gmo-mir-18b | MIR-17 | AAGGUGC | MIMAT0044342 | None | scaffold08698 | 72457 | 72520 | - | Gnathostomata | Vertebrata | Unknown | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
