| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Gi | He | In | Li | Sk | Sp | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-338-P1 | gmo-mir-338-2 | MIR-338 | CCAGCAU | MIMAT0044152 | MIMAT0044153 | GeneScaffold_1790 | 294559 | 294620 | - | Vertebrata | Vertebrata | No | 1 | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-338-P2a | gmo-mir-338-1 | MIR-338 | CCAGCAU | MIMAT0044177 | MIMAT0044153 | GeneScaffold_2140 | 179542 | 179603 | - | Clupeocephala | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-338-P2b | gmo-mir-338-3 | MIR-338 | CCAGCAU | MIMAT0044309 | MIMAT0044153 | GeneScaffold_640 | 8792 | 8852 | - | Clupeocephala | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
