| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Gi | He | In | Li | Sk | Sp | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-138-P1a | gmo-mir-138-3 | MIR-138 | GCUGGUG | MIMAT0044223 | MIMAT0044224 | GeneScaffold_3530 | 55998 | 56058 | + | Clupeocephala | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-138-P1b | gmo-mir-138-2 | MIR-138 | GCUGGUG | MIMAT0044223 | MIMAT0044320 | GeneScaffold_896 | 27322 | 27382 | + | Clupeocephala | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-138-P2 | gmo-mir-138-1 | MIR-138 | GCUGGUG | MIMAT0044223 | None | GeneScaffold_606 | 3847 | 3912 | - | Vertebrata | Vertebrata | Unknown | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
