Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Gi | He | In | Li | Sk | Sp | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gmo-Mir-27-P4b | gmo-mir-27a-1 | MIR-27 | UCACAGU | None | MIMAT0044102 | GeneScaffold_2105 | 1930293 | 1930354 | + | Clupeocephala | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gmo-Mir-27-P4a | gmo-mir-27a-2 | MIR-27 | UCACAGU | MIMAT0044101 | MIMAT0044102 | GeneScaffold_1112 | 350547 | 350610 | - | Clupeocephala | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gmo-Mir-27-P3 | gmo-mir-27c | MIR-27 | UCACAGU | MIMAT0044332 | MIMAT0044333 | scaffold03886 | 4252 | 4313 | - | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gmo-Mir-27-P2b | gmo-mir-27b | MIR-27 | UCACAGU | MIMAT0044008 | MIMAT0044009 | contig145249 | 115 | 177 | - | Clupeocephala | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gmo-Mir-27-P1 | gmo-mir-27d | MIR-27 | UCACAGU | MIMAT0046043 | MIMAT0046044 | contig135158 | 456 | 519 | - | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all