Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Br | Em | Ey | Gu | Gu | He | Li | Li | Ov | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-135-P4b | dre-mir-135c-2 | MIR-135 | AUGGCUU | MIMAT0001833 | None | chr23 | 18063203 | 18063264 | - | Clupeocephala | Chordata | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-135-P4a | dre-mir-135c-1 | MIR-135 | AUGGCUU | MIMAT0001833 | None | chr11 | 38175079 | 38175140 | - | Clupeocephala | Chordata | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-135-P2a | dre-mir-135a | MIR-135 | AUGGCUU | MIMAT0003348 | None | chr25 | 31044133 | 31044192 | - | Clupeocephala | Chordata | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-135-P1 | dre-mir-135b | MIR-135 | AUGGCUU | MIMAT0003032 | MIMAT0032006 | chr8 | 26005600 | 26005660 | + | Gnathostomata | Chordata | No | 1 | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all