Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Br | Em | Ey | Gu | Gu | He | Li | Li | Ov | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-29-P2d2 | None | MIR-29 | AGCACCA | None | None | chr23 | 32439975 | 32440034 | - | Clupeocephala | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-29-P2b1 | dre-mir-29a | MIR-29 | AGCACCA | None | MIMAT0001802 | chr4 | 11606782 | 11606841 | - | Clupeocephala | Bilateria | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-29-P1d2 | dre-mir-29b3 | MIR-29 | AGCACCA | MIMAT0048667 | MIMAT0048668 | chr23 | 32440125 | 32440189 | - | Clupeocephala | Bilateria | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-29-P1d1 | dre-mir-29b-1 | MIR-29 | CUGAAUU | None | MIMAT0001801 | chr6 | 47467922 | 47467983 | + | Clupeocephala | Bilateria | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-29-P1b1 | dre-mir-29b-2 | MIR-29 | AGCACCA | None | MIMAT0001801 | chr4 | 11608208 | 11608269 | - | Clupeocephala | Bilateria | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all