Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Ea | Fe | Fe | La | La | Ma | Ma | To | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cte-Mir-2686-P3 | cte-mir-2686b | MIR-2686 | AGAUGUU | None | MIMAT0013537 | CAPTEscaffold_174 | 220806 | 220865 | + | C. teleta | Sedentaria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cte-Mir-2686-P2 | cte-mir-2686a | MIR-2686 | AGAUGUU | MIMAT0013535 | MIMAT0013536 | CAPTEscaffold_174 | 220637 | 220693 | + | C. teleta | Sedentaria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cte-Mir-2686-P1 | cte-mir-2686c | MIR-2686 | AGAUGUU | None | MIMAT0013538 | CAPTEscaffold_174 | 220483 | 220549 | + | C. teleta | Sedentaria | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all