| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Fe | Fe | Fe | Fe | Ma | Ma | Ma | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Csc-Mir-10-P1q1 V | None | MIR-10 | ACCCUGU | None | None | NW_019384341.1 | 354569 | 354629 | - | C. sculpturatus | Eumetazoa | 2 | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Csc-Mir-10-P1q2 V | None | MIR-10 | ACCCUGU | None | None | NW_019384341.1 | 345312 | 345372 | - | C. sculpturatus | Eumetazoa | 2 | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Csc-Mir-10-P1q3 V | None | MIR-10 | ACCCUGU | None | None | NW_019384341.1 | 336261 | 336321 | - | C. sculpturatus | Eumetazoa | 2 | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Csc-Mir-10-P1r | None | MIR-10 | ACCCUGU | None | None | NW_019384862.1 | 289995 | 290055 | + | C. sculpturatus | Eumetazoa | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
