Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Fe | Fe | Fe | Fe | Ma | Ma | Ma | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Csc-Mir-96-P3x | None | MIR-96 | AUGGCAC | None | None | NW_019385963.1 | 35887 | 35949 | - | C. sculpturatus | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Csc-Mir-96-P3w | None | MIR-96 | AUGGCAC | None | None | NW_019385290.1 | 223516 | 223575 | + | C. sculpturatus | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Csc-Mir-96-P2w | None | MIR-96 | UUGGCAC | None | None | NW_019385290.1 | 224908 | 224968 | + | C. sculpturatus | Bilateria | Unknown | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Csc-Mir-96-P1x | None | MIR-96 | UUGGCAC | None | None | NW_019385963.1 | 35587 | 35647 | - | C. sculpturatus | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Csc-Mir-96-P1w | None | MIR-96 | UUGGCAC | None | None | NW_019385290.1 | 225058 | 225118 | + | C. sculpturatus | Bilateria | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all