Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Te | Te | Te | To | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cpi-Mir-29-P1b V | cpi-mir-29b-1 | MIR-29 | AGCACCA | MIMAT0037671 | MIMAT0037672 | JH584592 | 6714640 | 6714703 | - | Gnathostomata | Bilateria | 2 | Yes | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cpi-Mir-29-P1d V | cpi-mir-29b-2 | MIR-29 | AGCACCA | MIMAT0037673 | MIMAT0037672 | JH584931 | 90890 | 90954 | - | Gnathostomata | Bilateria | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cpi-Mir-29-P2b | cpi-mir-29a-1 | MIR-29 | AGCACCA | MIMAT0037668 | MIMAT0037669 | JH584592 | 6713467 | 6713526 | - | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cpi-Mir-29-P2d | cpi-mir-29a-2 | MIR-29 | AGCACCA | MIMAT0037670 | MIMAT0037669 | JH584931 | 87938 | 87997 | - | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all