| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Te | Te | Te | To | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpi-Mir-33-P1 | cpi-mir-33-2 | MIR-33 | UGCAUUG | MIMAT0037689 | MIMAT0037691 | JH584542 | 9197615 | 9197674 | + | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpi-Mir-193-P2a | cpi-mir-365-1 | MIR-193 | AAUGCCC | None | MIMAT0037870 | JH584814 | 1965562 | 1965622 | - | Vertebrata | Bilateria | Yes | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpi-Mir-193-P2b | cpi-mir-365-2 | MIR-193 | AAUGCCC | MIMAT0037871 | MIMAT0037870 | JH584464 | 1875173 | 1875235 | + | Vertebrata | Bilateria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
