Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Te | Te | Te | To | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cpi-Mir-124-P1 V | cpi-mir-124-2 | MIR-124 | AAGGCAC | MIMAT0037726 | MIMAT0037727 | JH584532 | 2383220 | 2383278 | - | Gnathostomata | Bilateria | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cpi-Mir-124-P2 V | cpi-mir-124-1 | MIR-124 | AAGGCAC | MIMAT0037726 | MIMAT0037727 | AHGY01384901 | 131 | 191 | - | Gnathostomata | Bilateria | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cpi-Mir-124-P3 V | cpi-mir-124-3 | MIR-124 | AAGGCAC | MIMAT0037726 | MIMAT0037727 | JH584900 | 191298 | 191357 | + | Gnathostomata | Bilateria | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cpi-Mir-124-P4 V | cpi-mir-124-4 | MIR-124 | AAGGCAC | MIMAT0037726 | MIMAT0037727 | JH584506 | 1072250 | 1072308 | + | Gnathostomata | Bilateria | 2 | No |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all