Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Li | Mi | Ov | Pe | Te | To | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-1-P1 | cli-mir-1a-2 | MIR-1 | GGAAUGU | MIMAT0038393 | MIMAT0038392 | scaffold23 | 298717 | 298777 | - | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-1-P2 | cli-mir-206 | MIR-1 | GGAAUGU | MIMAT0038588 | MIMAT0038589 | C16600502 | 233 | 292 | + | Gnathostomata | Bilateria | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-1-P3 | cli-mir-1a-1 | MIR-1 | GGAAUGU | MIMAT0038391 | MIMAT0038392 | scaffold36 | 3131822 | 3131882 | - | Gnathostomata | Bilateria | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-1-P4 | cli-mir-1b | MIR-1 | GGAAUGU | MIMAT0038394 | MIMAT0038395 | scaffold391 | 951021 | 951083 | - | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all