| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | An | An | An | Bl | Ce | Co | He | Hi | Hi | Hy | Ki | Ki | Li | Lu | Ov | Sk | Te | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cfa-Mir-8-P1a | cfa-mir-200b | MIR-8 | AAUACUG | MIMAT0009864 | None | chr5 | 56368408 | 56368466 | + | Vertebrata | Nephrozoa | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cfa-Mir-8-P1b | cfa-mir-200c | MIR-8 | AAUACUG | None | MIMAT0006664 | chr27 | 38082097 | 38082159 | - | Vertebrata | Nephrozoa | No | 1 | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cfa-Mir-8-P2a | cfa-mir-200a | MIR-8 | AACACUG | MIMAT0009865 | None | chr5 | 56369078 | 56369138 | + | Vertebrata | Nephrozoa | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cfa-Mir-8-P2b | cfa-mir-141 | MIR-8 | AACACUG | None | MIMAT0009876 | chr27 | 38081675 | 38081739 | - | Vertebrata | Nephrozoa | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cfa-Mir-8-P3a | cfa-mir-429 | MIR-8 | AAUACUG | None | MIMAT0001539 | chr5 | 56370524 | 56370582 | + | Vertebrata | Nephrozoa | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
