Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | An | An | An | Bl | Ce | Co | He | Hi | Hi | Hy | Ki | Ki | Li | Lu | Ov | Sk | Te | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cfa-Mir-196-P1 | cfa-mir-196b | MIR-196 | AGGUAGU | MIMAT0006620 | None | chr14 | 40344005 | 40344062 | - | Gnathostomata | Olfactores | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cfa-Mir-196-P3 | cfa-mir-196a-1 | MIR-196 | AGGUAGU | MIMAT0006662 | None | chr9 | 24895683 | 24895742 | - | Gnathostomata | Olfactores | Unknown | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cfa-Mir-196-P4 | cfa-mir-196a-2 | MIR-196 | AGGUAGU | MIMAT0006662 | None | chr27 | 1270718 | 1270776 | - | Gnathostomata | Olfactores | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all