Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | An | An | An | Bl | Ce | Co | He | Hi | Hi | Hy | Ki | Ki | Li | Lu | Ov | Sk | Te | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cfa-Mir-188-P3 | cfa-mir-660 | MIR-188 | ACCCAUU | MIMAT0006760 | None | chrX | 42783965 | 42784023 | + | Eutheria | Eutheria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cfa-Mir-188-P2 | cfa-mir-188 | MIR-188 | AUCCCUU | MIMAT0009880 | None | chrX | 42775072 | 42775131 | + | Eutheria | Eutheria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cfa-Mir-188-P1 | cfa-mir-532 | MIR-188 | AUGCCUU | MIMAT0006758 | None | chrX | 42774680 | 42774738 | + | Eutheria | Eutheria | No | 1 | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all