Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Sk | Ta | Ta | To | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aca-Mir-1-P1 | aca-mir-1a-1 | MIR-1 | GGAAUGU | MIMAT0021839 | MIMAT0021840 | 4 | 38859458 | 38859518 | + | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aca-Mir-1-P2 | aca-mir-206 | MIR-1 | GGAAUGU | MIMAT0021857 | MIMAT0021858 | 1 | 122853042 | 122853101 | + | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aca-Mir-1-P3 | aca-mir-1a-2 | MIR-1 | GGAAUGU | MIMAT0021841 | MIMAT0021840 | 4 | 151823211 | 151823271 | + | Gnathostomata | Bilateria | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Aca-Mir-1-P4 | aca-mir-1b | MIR-1 | GGAAUGU | MIMAT0021842 | MIMAT0021843 | GL343308.1 | 91131 | 91193 | + | Gnathostomata | Bilateria | No |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all