MirGeneDB ID | Ete-Mir-154-P30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-154 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AGGACAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Lesser hedgehog tenrec (Echinops telfairi) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Ete-Mir-154-P1 Ete-Mir-154-P2-v1 Ete-Mir-154-P2-v2 Ete-Mir-154-P3a-v1 Ete-Mir-154-P3a-v2 Ete-Mir-154-P4a Ete-Mir-154-P4b Ete-Mir-154-P5 Ete-Mir-154-P6 Ete-Mir-154-P7 Ete-Mir-154-P8 Ete-Mir-154-P9 Ete-Mir-154-P10 Ete-Mir-154-P12 Ete-Mir-154-P13 Ete-Mir-154-P14 Ete-Mir-154-P16 Ete-Mir-154-P17 Ete-Mir-154-P18 Ete-Mir-154-P19 Ete-Mir-154-P20-v1 Ete-Mir-154-P20-v2 Ete-Mir-154-P21 Ete-Mir-154-P22 Ete-Mir-154-P24 Ete-Mir-154-P25 Ete-Mir-154-P26 Ete-Mir-154-P27 Ete-Mir-154-P28 Ete-Mir-154-P29 Ete-Mir-154-P31 Ete-Mir-154-P32 Ete-Mir-154-P36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-154-P30 Cfa-Mir-154-P30 Cpo-Mir-154-P30 Dno-Mir-154-P30 Hsa-Mir-154-P30 Mml-Mir-154-P30 Mmu-Mir-154-P30 Ocu-Mir-154-P30 Rno-Mir-154-P30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (echTel2) |
JH980297: 82311879-82311934 [-] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GGUCAGCGUCUCUCAUGGUAUUUGUAGACGCGGUUGACCAUAGUGUGUACGCUUUAUUGAUGACGUAGGACACAUGGUCUACUUCUUCUCAAUAUCACACCUCGGCUCGGAAGACUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GGUCAGCGUCUCUCAUGGUAU---| U CGC U A G- CUUUA UUG AGA GGU GACCAU GUGU UACG U AAC UCU UCA CUGGUA CACA AUGC U UCAGAAGGCUCGGCUCCACACUAU^ - UCU U - GG AGUAG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Ete-Mir-154-P30_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CGGUUGACCAUAGUGUGUACG -21
Get sequence
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Mature sequence | Ete-Mir-154-P30_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- UAGGACACAUGGUCUACUUCU -56
Get sequence
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