| MirGeneDB ID | Ete-Mir-154-P19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Family name | MIR-154 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AACAAAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Lesser hedgehog tenrec (Echinops telfairi) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Ete-Mir-154-P1 Ete-Mir-154-P2-v1 Ete-Mir-154-P2-v2 Ete-Mir-154-P3a-v1 Ete-Mir-154-P3a-v2 Ete-Mir-154-P4a Ete-Mir-154-P4b Ete-Mir-154-P5 Ete-Mir-154-P6 Ete-Mir-154-P7 Ete-Mir-154-P8 Ete-Mir-154-P9 Ete-Mir-154-P10 Ete-Mir-154-P12 Ete-Mir-154-P13 Ete-Mir-154-P14 Ete-Mir-154-P16 Ete-Mir-154-P17 Ete-Mir-154-P18 Ete-Mir-154-P20-v1 Ete-Mir-154-P20-v2 Ete-Mir-154-P21 Ete-Mir-154-P22 Ete-Mir-154-P24 Ete-Mir-154-P25 Ete-Mir-154-P26 Ete-Mir-154-P27 Ete-Mir-154-P28 Ete-Mir-154-P29 Ete-Mir-154-P30 Ete-Mir-154-P31 Ete-Mir-154-P32 Ete-Mir-154-P36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-154-P19 Cfa-Mir-154-P19 Cpo-Mir-154-P19 Dno-Mir-154-P19 Hsa-Mir-154-P19 Mml-Mir-154-P19 Mmu-Mir-154-P19 Ocu-Mir-154-P19 Rno-Mir-154-P19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (echTel2) |
JH980297: 82304366-82304423 [-] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUACCAGUAUUAGCCUCUGGCACCUGAAAAGAAGUUGCCCAUGUUAUUUUCGCUUUAUAUGUGACGAAACAAACAUGGUGCACUUCUUUUUCGGUACCAACUCUCACCCUGAAGAGCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CUACCAGUAUUAGCCUC--| C U U - AU CUUUA UGG ACC GAAAAGAAGU GC CCAUGUU UUUCG U ACC UGG UUUUUCUUCA CG GGUACAA AAAGC A UCGAGAAGUCCCACUCUCA^ A C - U AC AGUGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | Ete-Mir-154-P19_5p* (predicted) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAAGUUGCCCAUGUUAUUUUCG -22
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | Ete-Mir-154-P19_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- AAACAAACAUGGUGCACUUCUU -58
Get sequence
|
