| MirGeneDB ID | Sko-Mir-4819 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-4819 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Saccoglossus (Saccoglossus kowalevskii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | sko-mir-4819 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Pfl-Mir-4819 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Enteropneusta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Enteropneusta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Skow_1.1) |
NW_003105607.1: 246707-246763 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUUGGAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUGCAUGUAUAUCAUGUAUGUGUUGCCCCCACUUGGACAAAAUGGAUGCGACGAGUACAAGGCCUCGCGUCAGUUUUGUCCAUGCGGGGGAGUUCUUUAGCAACGUUGGACUGUUAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UUGCAUGUAUAUCAUGUAUGUGUUG--| ACU G CGAGUA CCCCC UGGACAAAAU GAUGCGA \ GGGGG ACCUGUUUUG CUGCGCU C AAUUGUCAGGUUGCAACGAUUUCUUGA^ CGU A CCGGAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Sko-Mir-4819_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0020019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUUGGACAAAAUGGAUGCGAC -22
Get sequence
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| Star sequence | Sko-Mir-4819_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020020 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- CGCGUCAGUUUUGUCCAUGCGG -57
Get sequence
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