MirGeneDB ID | Pab-Mir-651 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-651 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Sumatran orangutan (Pongo abelii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cja-Mir-651 Hsa-Mir-651 Mml-Mir-651 Mmr-Mir-651 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Primates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Primates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_028885655.2_NHGRI_mPonAbe1-v2.0_traces) |
CM054702.2: 8121634-8121693 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUAGGAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCCUAGAUCUACAGAAAUCUAUCACUGCUUUUUAGGAUAAGUUUGACUUUUGUUCAAAUAAAAAUGCAAAAGGAAAGUGUAUCCUAAAAGGCAAUGACAGUUUAAUGUGUUUCUGACAUGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UCCUAGAUCUACAGAAAU--| A C AG GA UUCAAA CU UCA UGCUUUUUAGGAUA UUU CUUUUG U GA AGU ACGGAAAAUCCUAU GAA GAAAAC A GUACAGUCUUUGUGUAAUUU^ C A GU AG GUAAAA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Pab-Mir-651_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUUAGGAUAAGUUUGACUUUUG -22
Get sequence
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Star sequence | Pab-Mir-651_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- AAAGGAAAGUGUAUCCUAAAAG -60
Get sequence
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