MirGeneDB ID | Mmr-Mir-651 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-651 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cja-Mir-651 Hsa-Mir-651 Mml-Mir-651 Pab-Mir-651 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Primates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Primates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007693.1: 93205393-93205451 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UAGGGCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCCUAGAUCUACAAAAAGCUAUCAUUGCCUUUAGGGCAAGCUUGACUUUUGUUCAAAUAGACAUGCAAAAGUCAAGUGUACCUUAAGAGGGAAUGAUAGUUUAAAAUCGUUCUCACAUGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 CCCUAGAUCUACAAAAA-- G -| CAA UUCAAA GCUAUCAUU CCUU UAGGG GCUUGACUUUUG U UGAUAGUAA GGAG AUUCC UGAACUGAAAAC A GUACACUCUUGCUAAAAUU G A^ AUG GUACAG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mmr-Mir-651_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUAGGGCAAGCUUGACUUUUG -21
Get sequence
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Star sequence | Mmr-Mir-651_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- AAAGUCAAGUGUACCUUAAGAG -59
Get sequence
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