| MirGeneDB ID | Pab-Mir-577 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-577 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Sumatran orangutan (Pongo abelii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cja-Mir-577 Hsa-Mir-577 Mml-Mir-577 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028885655.2_NHGRI_mPonAbe1-v2.0_traces) |
CM054682.2: 136456920-136456978 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UAGAUAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAAGGCAGGCUGUAUUUGGGGGAGUGAAGAGUAGAUAAAAUAUUGGUACCUGAUGAAUCUGAGGCCAGGUUUCAAUACUUUAUCUGCUCUUCAUUUCCCCAUAUCUACUUACUGUAGGUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CAAGGCAGGCUGUAUUU--| A U AUGAAU GGGGGAGUGAAGAGUAGAUAAA UAUUGG ACCUG \ CCCCUUUACUUCUCGUCUAUUU AUAACU UGGAC C UGGAUGUCAUUCAUCUAUA^ C U CGGAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Pab-Mir-577_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUAGAUAAAAUAUUGGUACCUG -22
Get sequence
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| Star sequence | Pab-Mir-577_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- GGUUUCAAUACUUUAUCUGCUC -59
Get sequence
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