| MirGeneDB ID | Cja-Mir-577 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-577 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | White-tufted-ear marmoset (Callithrix jacchus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Hsa-Mir-577 Mml-Mir-577 Pab-Mir-577 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_011100555.2_mCalJa1.2.pat.X_genomic) |
CM021917.1: 78687398-78687456 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UAGAUAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAUGGCAGGCUGUAUUUGGAGGAAUGAAGAGUAGAUAAGGUACUGGUACCUGAUGAAUCUGAGGCCAGGUUUCAAUACUUUAUCUACUUUUCAUUUCCCCAAACGUACUUACUGUAGGUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AAUGGCAGGCUGUAUUU--| A C U AUGAAU GG GGAAUGAAGAGUAGAUAAGGUA UGG ACCUG \ CC CUUUACUUUUCAUCUAUUUCAU ACU UGGAC C UGGAUGUCAUUCAUGCAAA^ C A U CGGAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cja-Mir-577_5p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUAGAUAAGGUACUGGUACCUG -22
Get sequence
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| Star sequence | Cja-Mir-577_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- GGUUUCAAUACUUUAUCUACUU -59
Get sequence
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