| MirGeneDB ID | Pab-Mir-3187 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3187 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Sumatran orangutan (Pongo abelii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cja-Mir-3187 Hsa-Mir-3187 Mml-Mir-3187 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028885655.2_NHGRI_mPonAbe1-v2.0_traces) |
CM054699.2: 561286-561345 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UGGCCAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CGCGGGGUCGUCCAGCGAGGGUGCGCUGGCCCUGGGCAGCGUGUGGCUGAAGGUCACCAUGUUCUCCUUGGCCAUGGGGCUGCGCGGGGCCAGCAGGUCCACGUCCACGCUGGCGCGCUUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CGCGGGGUCGUCCAGCGA-- UGC G GU-| G UCACC GGG GCUGGCCCUG GCAGC GUGGCU AAGG A CCU CGACCGGGGC CGUCG UACCGG UUCC U UUCGCGCGGUCGCACCUGCA GGA G GGG^ - UCUUG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Pab-Mir-3187_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCUGGGCAGCGUGUGGCUGAAGG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Pab-Mir-3187_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UUGGCCAUGGGGCUGCGCGGGGC -60
Get sequence
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