| MirGeneDB ID | Obi-Mir-12584 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-12584 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | California two-spot octopus (Octopus bimaculoides) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Obi-Mir-12584-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Octopus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Octopus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (PRJNA270931_OBI) |
KQ415659: 1637502-1637560 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-12584-v2) |
Mir-12584-v1
KQ415659: 1637501-1637561 [+]
Ensembl
Mir-12584-v2 KQ415659: 1637502-1637560 [+] Ensembl |
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| Variant | Obi-Mir-12584-v2 |
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| Seed | UGAGCAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGGAACGAUGAGUGAAAAGCCUGGAAAAGUCUGAGCAAAGGAAAUGUUAGGCCGUAAAAUAUUCCUGGCAGCAUGUUCUUUUCUCUGAUUAGUCCAGGUUUCAAACAAUCGCGUGGAAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGGAACGAUGAGUGAAA--| AA U C A AG UAAAA AGCCUGGA AGUC GAG AAAGGA AUGUU GCCG \ UUGGACCU UUAG CUC UUUCUU UACGA CGGU U AAAGGUGCGCUAACAAACU^ GA U U G -- CCUUA 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Obi-Mir-12584-v2_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUGAGCAAAGGAAAUGUUAGGCCG -24
Get sequence
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| Star sequence | Obi-Mir-12584-v2_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- GCAGCAUGUUCUUUUCUCUGAU -59
Get sequence
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| Variant | Obi-Mir-12584-v1 |
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| Seed | CUGAGCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUGGAACGAUGAGUGAAAAGCCUGGAAAAGUCUGAGCAAAGGAAAUGUUAGGCCGUAAAAUAUUCCUGGCAGCAUGUUCUUUUCUCUGAUUAGUCCAGGUUUCAAACAAUCGCGUGGAAAUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UUGGAACGAUGAGUGAA--| AA U C A AG GUAAAA AAGCCUGGA AGUC GAG AAAGGA AUGUU GCC \ UUUGGACCU UUAG CUC UUUCUU UACGA CGG U UAAAGGUGCGCUAACAAAC^ GA U U G -- UCCUUA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Obi-Mir-12584-v1_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCUGAGCAAAGGAAAUGUUAGGCC -24
Get sequence
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| Star sequence | Obi-Mir-12584-v1_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- CAGCAUGUUCUUUUCUCUGAUU -61
Get sequence
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