MirGeneDB ID | Obi-Mir-12559-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-12559 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | California two-spot octopus (Octopus bimaculoides) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Obi-Mir-12559-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Ovu-Mir-12559-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Octopus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Octopus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (PRJNA270931_OBI) |
KQ419311: 241025-241083 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GCUGGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUAACGUCUACAUUAAAAGGUUUCACUGGAUGCUGGAAGACGGGUAAUGGGUGUACAAUACUGAAGCACCCAAUCGGUCCUCCCCCAUCCAGAGGAUUCCACAUAACGCCAAGUAUAUAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UUAACGUCUACAUUAAAA- UU A-| CU A G AA ACAAU GG UC CUGGAUG GGA GAC GGU UGGGUGU \ CC AG GACCUAC CCU CUG CUA ACCCACG A AUAUAUGAACCGCAAUACA UU GA^ CC C G -- AAGUC 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Obi-Mir-12559-P2_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGCUGGAAGACGGGUAAUGGGUGU -24
Get sequence
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Star sequence | Obi-Mir-12559-P2_3p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- ACCCAAUCGGUCCUCCCCCAUC -59
Get sequence
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