| MirGeneDB ID | Obi-Mir-12523 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-12523 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | California two-spot octopus (Octopus bimaculoides) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Esc-Mir-12523 Ovu-Mir-12523 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Coleoidea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Coleoidea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (PRJNA270931_OBI) |
KQ429281: 7572-7631 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAGAACA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCAAUGAGUUUAAUGCAGUCAGUUGAGUUUAGUGGCAUUUAAUGUUCUCUACGUAACAUUAGCAACGACGAGAACAGUAGAUGUCAUUGAGUGAAACUAACAUCUCACAAUUUAGGGCUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UCAAUGAGUUUAAUGCA--| C GA A UACGUAACA GU AGUU GUUUAGUGGCAUUUA UGUUCUC U CA UCAA UGAGUUACUGUAGAU ACAAGAG U CUCGGGAUUUAACACUCUA^ A AG G CAGCAACGA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Obi-Mir-12523_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGUGGCAUUUAAUGUUCUCUAC -22
Get sequence
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| Mature sequence | Obi-Mir-12523_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- CGAGAACAGUAGAUGUCAUUGA -60
Get sequence
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