| MirGeneDB ID | Oan-Novel-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | OAN-NOVEL-3 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Platypus (Ornithorhynchus anatinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mOrnAna1.p.v1_plustraces) |
NC_041753.1: 38081613-38081670 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Novel-3) |
Novel-3
NC_041753.1: 38081613-38081670 [-]
Mir-873-v1 NC_041753.1: 38127936-38127994 [-] Mir-873-v2 NC_041753.1: 38127937-38127993 [-] |
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| Seed | AUCAAGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAGGAAUUGUCUCUAUUGCUGAGUUGUACUUAUCAAGCGCUUAGAACAGUGCAUCUGAGUGCGAGCACUGUUCCAAGUGCUUGAUAAGUACAGCAGAAGCACAGGAGCUUGCACUCUAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CAGGAAUUGUCUCUAUU- GA-| A AUCUG GCU GUUGUACUUAUCAAGCGCUU GAACAGUGC A CGA CGACAUGAAUAGUUCGUGAA CUUGUCACG G AUCUCACGUUCGAGGACA AGA^ C AGCGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Oan-Novel-3_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UAUCAAGCGCUUAGAACAGUGC -22
Get sequence
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| Star sequence | Oan-Novel-3_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- ACUGUUCCAAGUGCUUGAUAAG -58
Get sequence
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