| MirGeneDB ID | Oan-Novel-13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | OAN-NOVEL-13 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Platypus (Ornithorhynchus anatinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mOrnAna1.p.v1_plustraces) |
NC_041744.1: 18125229-18125291 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Novel-13) |
Novel-13
NC_041744.1: 18125229-18125291 [+]
Mir-155 NC_041744.1: 18141409-18141470 [-] |
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| Seed | ACGGGAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAUGAAGGAACGGGGGCCGCGACGGUGGGAUCCGUCAAGCGCCUCCCGCGCGCUCGCGACGGUGCCCCGCGCACGGGAGGCGCUUGACGAAUCCCAACGGCGUCGACGAGUGCCAGAAUCACUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AAUGAAGGAACGGGGGC- -| A G C C CUCGCGAC CG CG CG UGGGAU CGUCAAGCGCCUCCCG GCG \ GC GC GC ACCCUA GCAGUUCGCGGAGGGC CGC G UCACUAAGACCGUGAGCA U^ G A A A GCCCCGUG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Oan-Novel-13_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCCGUCAAGCGCCUCCCGCGCG -22
Get sequence
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| Mature sequence | Oan-Novel-13_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- CACGGGAGGCGCUUGACGAAUC -63
Get sequence
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