| MirGeneDB ID | Oan-Novel-10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | OAN-NOVEL-10 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Platypus (Ornithorhynchus anatinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | O. anatinus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mOrnAna1.p.v1_plustraces) |
NC_041739.1: 57272420-57272476 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Novel-10) |
Mir-383-v2
NC_041739.1: 57271954-57272016 [+]
Mir-383-v1 NC_041739.1: 57271955-57272016 [+] Novel-10 NC_041739.1: 57272420-57272476 [+] |
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| Seed | GGUAUUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUGAAUCCAUCUCAGGGCUUUCAAUCCCUGUAACCGCUUAAUAUAUGCCAUAAUCAAUCAAUCAAUGGUAUUUGUUGAGCGUUUACGGGGUGCAGAGCACUGUACUAAGCACUUGGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UUGAAUCCAUCUCAGGG--- -| AU C U AAUCAA CUUU CA CCCUGUAA CGCUUAAUA AUGCCAU \ GAGA GU GGGGCAUU GCGAGUUGU UAUGGUA U GGGUUCACGAAUCAUGUCAC C^ -- U U ACUAAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Oan-Novel-10_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UAACCGCUUAAUAUAUGCCAUA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Oan-Novel-10_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- UGGUAUUUGUUGAGCGUUUACG -57
Get sequence
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