MirGeneDB ID | Nve-Mir-9424-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-9424 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Starlet sea anemone (Nematostella vectensis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | nve-mir-9424b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Nve-Mir-9424-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | N. vectensis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | N. vectensis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_000209225.1_ASM20922v1_NVE) |
NW_001833008.1: 5527-5578 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AAAGCUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
ACAGUCUUGGACAUACCGUCAUUUAAGACUGCCUCGAUGAGCCAACUAUACAGAUAUCUGUAAAGCUGGUUUAUCGAGGCAGUCUUUAAGGACGGUGUCUGAUGAGCUUGCAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 ACAGUCUUGGACAUACC--| AUUU A A GA GUC AAGACUGCCUCGAUGAGCCA CU UACA U CAG UUCUGACGGAGCUAUUUGGU GA AUGU A ACGUUCGAGUAGUCUGUGG^ GAAU C A CU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Nve-Mir-9424-P1_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GCCUCGAUGAGCCAACUAUACA -22
Get sequence
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Mature sequence | Nve-Mir-9424-P1_3p |
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mirBase accession | MIMAT0035392 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
30- UAAAGCUGGUUUAUCGAGGCAG -52
Get sequence
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