| MirGeneDB ID | Nve-Mir-2032-P2b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2032 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Starlet sea anemone (Nematostella vectensis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | nve-mir-2032b-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Nve-Mir-2032-P1 Nve-Mir-2032-P2a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | N. vectensis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | N. vectensis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_000209225.1_ASM20922v1_NVE) |
NW_001834253.1: 427071-427121 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2032-P2b) |
Mir-2032-P2b
NW_001834253.1: 427071-427121 [-]
Ensembl
Mir-2032-P2a NW_001834253.1: 447174-447224 [-] Ensembl Mir-2032-P1 NW_001834253.1: 473305-473355 [-] Ensembl |
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| Seed | CGCUGCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCGAAGAGGAUCGCGAGCUCACCGUUGCUGUCGCUGCAACAGUUAGCUAGCAUUUAUUGCGAGGUAACUGUUGCAGCAUCCAUGACUGUGAGGUCAGUAUUUCAGCAUCUAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CCGAAGAGGAUCGCGAG--| C C UC- G A UU CUCAC GUUG UG GCUGCAACAGUUA CU GCA \ GAGUG CAGU AC CGACGUUGUCAAU GA CGU U AUCUACGACUUUAUGACUG^ U - CUA G G UA . 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| Comment | There is a second Dicer cut -1 on both arms. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Nve-Mir-2032-P2b_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0009786 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCGCUGCAACAGUUAGCUAGCA -22
Get sequence
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| Star sequence | Nve-Mir-2032-P2b_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0009787 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
29- CGAGGUAACUGUUGCAGCAUCC -51
Get sequence
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