| MirGeneDB ID | Neu-Novel-8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | NEU-NOVEL-8 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tammar Wallaby (Notamacropus eugenii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | N. eugenii | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | N. eugenii | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028372415.1_mMacEug1.pri) |
CM051815.1: 300853085-300853141 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Novel-8) |
Mir-33-P3
CM051815.1: 300852453-300852511 [+]
UCSC
Ensembl
Novel-8 CM051815.1: 300853085-300853141 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | UCAGUCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAACCUGGCCUCCUGGCUCACCGGCCAGUCCUCAGUCUAUGCCAGCACCAGUCUGUUUGCUGCUGGUACUGGCAUAGACUGUUUGGUUGUCUGGUCUGACAAGGCUCCUGUGGAGAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CAACCUGGCCUCCUGGCUC--- C GU CU-| C CUGU ACCGG CA C CAGUCUAUGCCAG ACCAGU \ UGGUC GU G GUCAGAUACGGUC UGGUCG U GAGAGGUGUCCUCGGAACAGUC U UG UUU^ A UCGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Neu-Novel-8_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUCAGUCUAUGCCAGCACCAGU -22
Get sequence
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| Co-mature sequence | Neu-Novel-8_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
33- UGGUACUGGCAUAGACUGUUUGGU -57
Get sequence
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