MirGeneDB ID | Neu-Mir-7385-o6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-7385 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Tammar Wallaby (Notamacropus eugenii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Neu-Mir-7385-o2 Neu-Mir-7385-o3 Neu-Mir-7385-o4 Neu-Mir-7385-o5 Neu-Mir-7385-o7 Neu-Mir-7385-o8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Mdo-Mir-7385-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | N. eugenii | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_028372415.1_mMacEug1.pri) |
CM051820.1: 12011172-12011230 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7385-o6) |
Mir-7385-o7
CM051820.1: 12009420-12009478 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-7385-o6 CM051820.1: 12011172-12011230 [-] UCSC Ensembl Mir-7385-o5 CM051820.1: 12011795-12011853 [-] UCSC Ensembl Mir-7385-o4 CM051820.1: 12014348-12014406 [-] UCSC Ensembl Mir-7385-o3 CM051820.1: 12016212-12016270 [-] UCSC Ensembl Mir-7385-o8 CM051820.1: 12017500-12017558 [-] UCSC Ensembl Mir-7385-o2 CM051820.1: 12018791-12018849 [-] UCSC Ensembl |
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Seed | UAUCAGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUGAACUAUUCAACCUCUAAGGUCACUUCUAUAUCAGGUAUUCUACCUUUUUGUGAAAUAAAGCUGAAAAGGUAGUUUACCAGAUGUGGAAGUAUCCUCUAAUGAUCAGCUGCCCUCAAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UUGAACUAUUCAACCUCUA--| UC A UU GUGAAA AGG ACUUCUAUAUC GGUA CUACCUUUUU \ UCC UGAAGGUGUAG CCAU GAUGGAAAAG U AACUCCCGUCGACUAGUAAUC^ UA A UU UCGAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Neu-Mir-7385-o6_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AUAUCAGGUAUUCUACCUUUUU -22
Get sequence
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Co-mature sequence | Neu-Mir-7385-o6_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- AAAGGUAGUUUACCAGAUGUGG -59
Get sequence
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