MirGeneDB ID | Neu-Mir-7363 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-7363 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Tammar Wallaby (Notamacropus eugenii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Mdo-Mir-7363 Sha-Mir-7363 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_028372415.1_mMacEug1.pri) |
CM051820.1: 28963798-28963856 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7363) |
Mir-7262-P7
CM051820.1: 28947104-28947168 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-7363 CM051820.1: 28963798-28963856 [+] UCSC Ensembl |
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Seed | UACCCAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUCACUGAGAAGACCUUCCAAAUGGACGAGAUCACAGAUCCGUUUGGGUAUUUUAGUAUGUGAAGAAGUACCCAAAGGAUCUGUGAUUUUGUAAGUUUGGGGAAUUCUACAUGUGGAGCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 AUCACUGAGAAGACCUU--| GG G UAGUA CCAAAU ACGAGAUCACAGAUCC UUUGGGUAUUU U GGUUUG UGUUUUAGUGUCUAGG AAACCCAUGAA G CGAGGUGUACAUCUUAAGG^ AA - GAAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Neu-Mir-7363_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AUCACAGAUCCGUUUGGGUAUUU -23
Get sequence
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Mature sequence | Neu-Mir-7363_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- GUACCCAAAGGAUCUGUGAUUU -59
Get sequence
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