MirGeneDB ID | Neu-Mir-7318-as | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-7318 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Tammar Wallaby (Notamacropus eugenii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Neu-Mir-7318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Mdo-Mir-7318 Sha-Mir-7318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | N. eugenii | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_028372415.1_mMacEug1.pri) |
CM051819.1: 155252592-155252650 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7318-as) |
Mir-7318
CM051819.1: 155252590-155252648 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-7318-as CM051819.1: 155252592-155252650 [+] UCSC Ensembl |
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Seed | UGCGUAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAGGAAAAGGGGCGAUUAUAAUACUCAUGGCCUCAGAUUUCUAUACGCAUUCAUGUAGAGAAUACAAAUGCGUAUAGAAAUCUGAGGGCAUGCGUACUAUUGACAAGAAAAGCACAAAAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 CAGGAAAAGGGGCGAUU--| A U G CAUGUAG AUA UAC CAUG CCUCAGAUUUCUAUACGCAUU \ UAU AUG GUAC GGAGUCUAAAGAUAUGCGUAA A AAAACACGAAAAGAACAGU^ C C G ACAUAAG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Neu-Mir-7318-as_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CCUCAGAUUUCUAUACGCAUUC -22
Get sequence
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Mature sequence | Neu-Mir-7318-as_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- AUGCGUAUAGAAAUCUGAGGGC -59
Get sequence
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