MirGeneDB ID | Mmu-Mir-7647 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-7647 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mmu-mir-7647 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mm10) |
chr5: 123522636-123522695 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AGUCCAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAAACACCAUUCAUAUAAAUUAAAAGUAUGAACUACCACCUCCUGGCCUUUUUUUUAAAAAGCACCAAAAGUCCAGGAGGUGGUAGUACACACUUUUAAUUCCAGCACUUGGGAGGCAGAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 AAAACACCAUUCAUAUA--| A A C UUUUAA AAUUAAAAGU UG ACUACCACCUCCUGG CUUUU A UUAAUUUUCA AC UGAUGGUGGAGGACC GAAAA A AGACGGAGGGUUCACGACC^ C A U CCACGA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mmu-Mir-7647_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0029796 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AACUACCACCUCCUGGCCUUUU -22
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-7647-5p miRDB: MIMAT0029796 |
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Mature sequence | Mmu-Mir-7647_3p |
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mirBase accession | MIMAT0029797 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- AAGUCCAGGAGGUGGUAGUACA -60
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-7647-3p miRDB: MIMAT0029797 |