| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-3105 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3105 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-3105 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr7: 144009267-144009325 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAGCAAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGUUGUGUAAGAAAGCUGAGCAGGCUCUGGAGAGCAAGCCCGUAAGCAGCGUAAGUUACUGAGGAACACUGCUUAUGAGCUUGCACUCCAUAGCCUCUGCUUCCACUCCUGCCUCUGGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AGUUGUGUAAGAAAGCUG --| C A C C AAGUUA AGC AGGCU UGGAG GCAAGC CGUAAGCAG GU \ UCG UCCGA ACCUC CGUUCG GUAUUCGUC CA C GGGUCUCCGUCCUCACCU UC^ U A A A AGGAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-3105_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0014941 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGAGCAAGCCCGUAAGCAGCGU -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3105-5p miRDB: MIMAT0014941 |
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| Co-mature sequence | Mmu-Mir-3105_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0014942 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- ACUGCUUAUGAGCUUGCACUCC -59
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3105-3p miRDB: MIMAT0014942 |
