| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-3098 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3098 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-3098 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr6: 125195807-125195867 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CCUAACA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGGCCCUCCACACAUUGUGGUUGGGAGGAGUCCUAACAGCAGGAGUAGGAGCUCUGAUUAUCCCCUGCUUCUGCUGCCUGCCUUUAGGACCCUUUCCCCACAACCGGCUGCCUUGCCCAGCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AGGCCCUCCACACAUUG----| UU GG A CA - UCUGAU UGG G AGG GUCCUAA GCAGG AGUAGGAGC U ACC C UCC CAGGAUU CGUCC UCGUCUUCG A CGACCCGUUCCGUCGGCCAAC^ C- UU - UC G UCCCCU . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-3098_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0014917 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCCUAACAGCAGGAGUAGGAGC -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3098-5p miRDB: MIMAT0014917 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-3098_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0014918 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- UUCUGCUGCCUGCCUUUAGGACC -61
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3098-3p miRDB: MIMAT0014918 |
