| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-3081 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3081 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-3081 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr16: 44558058-44558115 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UGCGCUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGUUGGAGCUCGAGCGCUGGGCUGGGGCUCAGACUGGAGCUUGGAGCGGUGAGCUGGACUCGGGCUUGCGCUCCGAUCUCUGAGCUGGGCUCUUGCCCGGAAUCCCAGCGCUUGACUGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GGUUGGAGCUCGAGCGC--| U AC C G UG UGGA UGGGC GGGGCUCAG UGGAG UUGGAGC G AGC \ GCCCG UCUCGGGUC GUCUC AGCCUCG C UCG C GUCAGUUCGCGACCCUAAG^ U GA U - GU GGCU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-3081_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0014870 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGACUGGAGCUUGGAGCGGUGAGC -24
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3081-5p miRDB: MIMAT0014870 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-3081_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0014871 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- UUGCGCUCCGAUCUCUGAGCUGG -58
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3081-3p miRDB: MIMAT0014871 |
