MirGeneDB ID | Mmu-Mir-3068 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-3068 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UGGAGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mmu-mir-3068 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Rno-Mir-3068 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Muridae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Muridae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mm10) |
chr12: 87437685-87437747 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AAGCAAGGGGGACAGAGUAUGCGAGAGUAAUUGGAGUUCAUGCAAGUUCUAACCAGCUUACUCAGUAGCUGGGUGAAUUGCAGUACUCCAACAUUCUGCUUCCAUCUGCUCAGUUCUCAUGCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 AAGCAAGGGGGACAGAGUAU----| G AA UCA G UAA AGCUUAC GC AGAGU UUGGAGU UGCAA UUC CC U CG UCUUA AACCUCA ACGUU AAG GG C UCGUACUCUUGACUCGUCUACCUU^ - C- UG- - UG- UCGAUGA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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Comment | There are Dicer cuts on the 3p arm -1 and -2 relative to what is annoated here. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mmu-Mir-3068_5p |
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mirBase accession | MIMAT0014842 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUGGAGUUCAUGCAAGUUCUAACC -24
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3068-5p miRDB: MIMAT0014842 |
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Star sequence | Mmu-Mir-3068_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0014843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
41- GGUGAAUUGCAGUACUCCAACA -63
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3068-3p miRDB: MIMAT0014843 |