| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-3067 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3067 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-3067 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr12: 81166165-81166224 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GUUCUCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUUCAGCCCAACUCCUGCCCCAGCUUCCCCAGUUCUCAGGCCCGCUGUGGUGUGAAGUUAGGUUCACCAAGCGGCUGCCCUGGGAGAGGGGGAGGUGUGCCUCCUCUUCCCCCUGCAUCUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UUUCAGCCCAACUCCUGCCCCA-- AG - --| G UGAAG GCUUCCCC UUCUCA GGC CCGCU UGGUG U UGGAGGGG GAGGGU CCG GGCGA ACCAC U UCUACGUCCCCCUUCUCCUCCGUG GA C UC^ - UUGGA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-3067_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0014840 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGUUCUCAGGCCCGCUGUGGUG -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3067-5p miRDB: MIMAT0014840 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-3067_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0014841 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- CCAAGCGGCUGCCCUGGGAGAGGG -60
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3067-3p miRDB: MIMAT0014841 |
