| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-3060 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3060 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-3060 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr11: 4139377-4139434 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CAUAGCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUUGCUGGUGAUGUCCUGGGCGUGGGGGUGGGGAGUGCUUCGUGCUUCUGGUUGAAGAGAAAAUGACCAUAGCACAGAAGCACUCCCACCAGCUUUGUCUGUGGCUUCAGGUGACCAUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AUUGCUGGUGAUGUCCU- U G-| G - UC GAAGA GGGCG GG GGUGGG AGUGCUUC GUGCU UGGUU \ UCUGU UC CCACCC UCACGAAG CACGA ACCAG G UACCAGUGGACUUCGGUG U GA^ - A U- UAAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-3060_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0014826 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GGGAGUGCUUCGUGCUUCUGGUU -23
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3060-5p miRDB: MIMAT0014826 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-3060_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0014827 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- CCAUAGCACAGAAGCACUCCCA -58
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3060-3p miRDB: MIMAT0014827 |
