| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-3057 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3057 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-3057 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr10: 81271610-81271675 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUGGAGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GAAACCUUGAGGUGUCCUGAAGGUGUGUGCAUUGGAGCUGAGAUUCUGCGGGAUGGAUUAGGAGUAUAUUGUCCUCCCACAGGCCCAGCUCAUAGCACAAGCCAUCGGCCAGGCCUUCAGCAUCGCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 GAAACCUUGAGGUGUCC--| A G AUUG AGAU C UGGAUUAGGA UGA GGU UGUGC GAGCUG UCUG GGGA \ GCU CCG ACACG CUCGAC GGAC CCCU G CGCUACGACUUCCGGACCG^ A A AUA- CC-- A CCUGUUAUAU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-3057_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0014822 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AUUGGAGCUGAGAUUCUGCGGGAU -24
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3057-5p miRDB: MIMAT0014822 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-3057_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0014823 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- UCCUCCCACAGGCCCAGCUCAUAGC -66
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3057-3p miRDB: MIMAT0014823 |
