| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-1929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1929 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCUAGGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-1929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr10: 44359692-44359755 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GAGUGGGAUCCUGAUUAGAACUGGGAGGUCUUCUAGGACUUUAUAGAGCAGAGGUUUGCAGCCUGUGACACUCAGCUCAUGGAGACCUAGGUGGCCUUGGGUUCUGAGCACCAGACAGGACUUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 GAGUGGGAUCCUGAUUA---| G G U A A A GUUUGCAG GAACU G AGGUC UCUAGG CUUUAU GAGC GAG \ CUUGG U UCCGG GGAUCC GAGGUA CUCG CUC C GUUCAGGACAGACCACGAGU^ G - U A - A ACAGUGUC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-1929_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0009392 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUCUAGGACUUUAUAGAGCAGAG -23
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0009392 TargetScanVert: mmu-miR-1929-5p miRDB: MIMAT0009392 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-1929_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0022729 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
42- CAGCUCAUGGAGACCUAGGUGG -64
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-1929-3p miRDB: MIMAT0022729 |
