| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-1929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1929 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-1929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr10: 44359692-44359755 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCUAGGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GAGUGGGAUCCUGAUUAGAACUGGGAGGUCUUCUAGGACUUUAUAGAGCAGAGGUUUGCAGCCUGUGACACUCAGCUCAUGGAGACCUAGGUGGCCUUGGGUUCUGAGCACCAGACAGGACUUGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 GAGUGGGAUCCUGAUUA---| G G U A A A GUUUGCAG GAACU G AGGUC UCUAGG CUUUAU GAGC GAG \ CUUGG U UCCGG GGAUCC GAGGUA CUCG CUC C GUUCAGGACAGACCACGAGU^ G - U A - A ACAGUGUC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| Comment | The Drosha cut is shifted -2 nt relative to the other annotated eutherians. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-1929_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0009392 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUCUAGGACUUUAUAGAGCAGAG -23
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0009392 TargetScanVert: mmu-miR-1929-5p miRDB: MIMAT0009392 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-1929_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0022729 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
42- CAGCUCAUGGAGACCUAGGUGG -64
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-1929-3p miRDB: MIMAT0022729 |
