| MirGeneDB ID | Mml-Mir-579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-579 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cja-Mir-579 Hsa-Mir-579 Pab-Mir-579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014341.1: 32516483-32516542 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCAUUUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGGAGUCAUAUUAGGUUAAUGCAAAAGUAAUCGCGGUUUGUGCCAAAUGGCGAUUUGAAUUAAUAAAUUCAUUUGGUACAAACCGCGAUUACUUUUGCAUCAGCUUAAUGCAGUCUUUUGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGGAGUCAUAUUAGGUUA--| CGAUUUGA AUGCAAAAGUAAUCGCGGUUUGUGCCAAAUGG A UACGUUUUCAUUAGCGCCAAACAUGGUUUACU U GUUUUCUGACGUAAUUCGAC^ UAAAUAAU . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mml-Mir-579_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCGCGGUUUGUGCCAAAUGGCGA -23
Get sequence
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| Mature sequence | Mml-Mir-579_3p (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0006440 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UUCAUUUGGUACAAACCGCGAUU -60
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-579 |
