MirGeneDB ID | Mml-Mir-4637 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-4637 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Hsa-Mir-4637 Pab-Mir-4637 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014341.1: 15065287-15065362 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | ACCAACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUCGUCCUUGAAAAAUUAAUUAGGACCCUUACUUGGAUCUGCGGUUAGUAUUUAAAUCGUAGAUUGUAUUUAGUUAGUUUUUAAUACCAACUGCAGAUUCAAGUGAGGGUUCUAACCCUAACCUCUAGAUUUUAAUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 UUCGUCCUUGAAAAAUUAA--| A UAAAUCGUAGAUUG UUAGGACCCUUACUUGGAUCUGCGGUU GUAUU U AAUCUUGGGAGUGAACUUAGACGUCAA CAUAA A UAAUUUUAGAUCUCCAAUCCC^ C UUUUUGAUUGAUUU 130 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mml-Mir-4637_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACUUGGAUCUGCGGUUAGUAUU -22
Get sequence
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Mature sequence | Mml-Mir-4637_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
54- UACCAACUGCAGAUUCAAGUGA -76
Get sequence
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